Como en casi todas las zonas montañosas, las diversas especies forestales varian en función de la altitud. Así suelen ocupar distintos pisos: el montano, por debajo de los 1300 metros; el subalpino, entre 1380 y 1900 metros y el alpino que se situaría por encima de los 1900 metros (en la zona sólo la cima de Cueva Valiente supera esta cota, con 1903 m.).
Zona Montana
Árboles y arbustos: los robles (Quercus tozza) mezclados, en menores proporciones, con otras leñosas, como olmos, mostajos (Sorbus aria), gerbal o serbal de los cazadores (Sorbus aucuparia), enebros, etc.
Matorrales: endrino (Prunus spinosa), espino albar o majuelo (Crataegus monogyna), rosal silvestre o escaramujo, zarzamora (Rubux ulmifolmis), tomillo o mejorana (Thymus mastichina), tomillo vulgar (Thymus vulgaris), romero, espliego (Lavandula latifolia medicus), piorno (Cytisus pugans), jara común o pringosa (Cistus ladaniferus), etc.
Zona Subalpina
Árboles: rebollo o melojar (Quercus pyrenaica), pino rojo o pino albar (Pinus sylvestris) -el más característico y abundante con mucho-, sabinas (Juniperus sabina), pino negral (Pinus nigra), etc.
Matorrales: arraclán (Frangula alnus), brezos (Erica arborea), saúco (Sambucus nigra), escobonales (Genista), piornos, enebros rastreros (Juniperus alpina), helechos, espliego, romero, jara y lavándulas, tejo (Texus baccata), acebo, cerezo silvestre (Prunus avium), etc.
Cervunales o prados alpinos: céspedes de Nardus stricta, Festuca indigesta y Festuca sulcata.
Otras especies de pequeño porte: saxifragas, saphagnos, Sedum hispanicus (uva de pájaro), Hieracium castellanum, Crocus carpetanum (azafrán de flores blancas lilacinas), siempreviva (Sempervivum montanum), variantes de líquenes tales como Permelia saxatilis, P. tiliacea, Umbilicaria, Arenaria muntana, Ranunculus carpetanus, botonera (Santolina rosmarinifolia), digital (Digitalis purpurea), etc.
Hay que señalar que la vertiente madrileña de Abantos es mucho más abundante en frondosas, y merece, a este respecto, la visita al arboreto "Luis Ceballos", donde se ofrece un nutrido conjunto de especies vegetales de la zona, así como un mariposario.
